تبلیغات
بیوانفورماتیك,bioinformatics,بیوانفورماتیک
منوی كاربری

این وبلاگ را صفحه خانگی خود كن !    به مدیر وبلاگ ایمیل بزنید !    این وبلاگ را به لیست علاقه مندی های خود اضافه كنید !

پیغام مدیر : به شما كاربر گرامی سلام عرض می كنم .بیوانفورماتیک علم نوینی است که در آن به وسیله نرم افزارهای کامپیوتری به تجزیه داده های زیستی میپردازند و حالا شما در تنها وبگاه بیوانفورماتیک به زبان فارسی قرار دارید. امیدوارم در این وبلاگ دقایقی خوبی را سپری كنید . برای آگاهی از امكانات این وبلاگ خواهشمندم كه تا آخر صفحه این وبلاگ را مشاهده نمایید. ایمیل شخصی من:babakbabaabasi@gmail.com .

نظرسنجی
نظر خود را در رابطه با وبلاگ و کیفیت مطالب موجود به من هم بگویید. برای این كاربر یكی از گزینه های زیر را انخاب كنید وسپس بر روی گزینه نتیجه كلیك كنید...






صفحات وبلاگ
لینك به ما / لوگوی دوستان
لینك به ما

بیو انفورماتیک


لوگوی دوستان

آمار وبلاگ
امروز :

بازدید های امروز :

بازدید های دیروز :

كل بازدیدها :

كل مطالب :

كل نظرات :

ایجاد صفحه : - ثانیه

یکشنبه 13 تیر 1389
دانشنامه بیوانفورماتیک (پروژه bio-use ) شروع به کار کرد
آدرس صفحه اصلی این دانشنامه www.ibp.ir/w میباشد

در صفحه نخست این پروژه این چنین آورده شده است:

این دانشنامه یکی از زیر مجموعه های پرتال بیوانفورماتیک ایرانیاناست. پیچیدگی دامنه تحقیقات بیوانفورماتیک بیانگر چالشی میان بیولوژیستها و طراحان ابزارهای بیوانفورماتیک است و بنابر این ارتباط تنگاتنگ این دو گروه را می طلبد. پذیرش و به کار گیری ابزارهای بیوانفورماتیک از سوی متخصصین جامعه زیست شناسی و پزشکی تنها در صورتی ممکن است که ابزارهای طراحی شده برای این منظور ،تمرکز اصلی خود را بر روی کاربران و جلب رضایت آنها قرار داده است. در این دانشنامه تحت عنوان پروژه bio-use سعی میشود در یک محیط متن باز به کاربران شیوه صحیح یک مطالعه بیوانفورماتیکی را بیاموزیم تا کاربر در دریایی از بانکهای اطلاعاتی و نرم افزارهای موجود سردرگم نشود. به این منظور در این پروژه اطلاعات را در قسمت های زیر در اختیار کاربران قرار میدهم

بخشهای جالب این دانشنامه به شرح زیر است:


نوشته شده توسط babak babaabasi ساعت 10:31 ب.ظ موضوع مطلب :‌ خبرهایی در زمینه بیوانفورماتیك ,

ویرایش شده در - و ساعت -

لینك ثابت | نظرات ()

جمعه 11 تیر 1389
کتاب الکترونیکی بیوانفورماتیک شامل 7 فصل, کتابی رایگان و بسیار جامع
کتاب الکترونیکی  ابزارهای بیوانفورماتیک  به شرح زیر در دست رس علاقه مندان قرار گرفته است

اطلاعات مناسب و فهرست به روز شده را در صفحه اختصاصی کتاب ببینید
کتاب-اینترنتی-بیوانفورماتیک/http://www.ibp.ir/w/index.php

فصلهای کتاب به شرح زیر میباشد:

فصل اول
این فصل را در آدرس زیر ببینید
http://ibp.ir/el/____Primary_Databanks_ims/index.html
معرفی پایگاههای اطلاعاتی اولیه و ابزارهای جستجو در آنها
مقدمه
پایگاه داده‌ها چیست؟
انواع پایگاه داده ها
پایگاه‌ داده‌ها در علوم زیستی
پایگاه‌های اطلاعاتی اولیه داده‌های زیستی
پایگاه های اطلاعاتی اولیه توالی DNA معرفی GenBank
پایگاه داده‌های Refseq
جستجوی متنی توالی‌های نوكلئوتیدی
پایگاه های اطلاعاتی اولیه توالی‌های پروتئینی ۱- پایگاه اطلاعات پروتئینی SwissProt
۲- پایگاه اطلاعات پروتئینی (PIR (Protein Information Resource
UniProt
پایگاه‌ داده‌های ساختار فضایی پروتئین‌ها (PDB (Protein Data Bank
سامانه‌های بازیابی اطلاعات از پایگاه های داده‌ها 1- Entrez
2-(SRS (Sequence Retrieval System

فصل دوم
این فصل را در آدرس زیر ببینید
http://ibp.ir/el/____BLAST_ims/index.html
همردیفی توالی ها و جستجوی BLAST
همردیفی دوگانه: (Pairwise Alignment)
امتیازدهی جایگزینی‌ها
امتیازدهی حذف و اضافه نمودن توالی ها
BLAST چگونه کار می کند؟
انواع BLAST

فصل سوم
این فصل را در آدرس زیر ببینید
http://ibp.ir/el/____Protein_Secondary_databanks_ims/index.html
معرفی پایگاه‌های اطلاعاتی ثانویه و ابزارهای جستجو در آنها
مقدمه
الف) توالی‌های توافقی (Consensus sequence):
توالی‌های الگو و پروفایل: (Pattern & Profile sequences)
مدل های ماركوف نهفته (Hidden Markov Models)
ماتریكس‌ امتیازی بر مبنای موقعیت: (Position Specific Scoring Matrix)
بلوك‌های توالی (Blocks) و اثر انگشت‌ها (Fingerprint)
جستجوی همزمان در پایگاه‌های اطلاعاتی ثانوی پروتئینی
موقعیت‌‌یابی پروتئین‌ها در سلول

فصل چهارم
این فصل را در آدرس زیر ببینید
http://ibp.ir/el/_______Genome_Projects__Access_to_Their_Data_ims/index.html
معرفی پروژه‌های ژنوم و راه‌های دسترسی به اطلاعات آنها
مقدمه
تهیه نقشه‌های ژنومی
تهیه كتابخانه‌های ژنومی
تعیین توالی‌های ژنومی
بهره‌برداری از پایگاه های اطلاعاتی ژنومی 1- استفاده از نرم‌افزار MapViewer
2- پایگاه ژنومی Ensemble
۳- پایگاه ژنومی UCSC Genome Browser
پایگاه UniGene
پایگاه RefSeq
پایگاه Entrez Gene
یكنواخت سازی نام‌گذاری ژن‌‌ها
تنوع ژنومی (Genome Diversity) پایگاه داده‌های آلل‌های انسان یا OMIM
پایگاه داده‌های SNP) Single Nucleotide Polymorphism)
مقایسه‌های ژنومی (Comparative Genomics)
پایگاه های اطلاعات مقایسه‌ای ژنوم ها
مسائل اخلاقی، مذهبی و حقوقی پروژه‌های ژنوم

فصل پنجم
این فصل را در آدرس زیر ببینید
http://ibp.ir/el/5_Transcriptomics_ims/index.html
ترانسكریپتومیكس
مقدمه
شناسایی توالی‌های قابل رونویسی
دسترسی به داده‌های ترانسکریپتومیکس
سنجش میزان بیان ژن‌ها
دسترسی به داده‌های بیان ژن‌ها
References

فصل ششم
این فصل را در آدرس زیر ببینید
http://ibp.ir/el/_6_-__Proteomics_ims/index.html
پروتئومیكس
مقدمه
جداسازی پروتئین ها
شناسایی پروتئین ها
تعیین ویژگی های پروتئین‌ها
روش طیف‌سنجی جرمی
شناسایی تغییرات پس از ترجمه
دسترسی به داده‌های پروتئومیکس پایگاه SWISS-2DPAGE
پایگاه PeptIdent
پایگاه داده‌های جرم‌های پپتیدی Mascot
پایگاه داده‌های جرم‌های پپتیدی FindMod
بیشتر بدانید

فصل هفتم
این فصل را در آدرس زیر ببینید
http://ibp.ir/el/_7_-__Metablolomics________System_Biology_ims/index.html
متابولمیكس و سیستم بیولوژی
مقدمه
پایگاه KEGG
اطلس های متابولیسمی و نقشه های ژنومی
مسیر های متابولیمسی ExPASy

سوالات و مشکلات خود را در رابطه با هر قسمت از کتاب میتوانید در انجمن اینترنتی  پرتال بیوانفورماتیک ایرانیان  به آدرس زیر مطرح کنید
www.ibp.ir/f
این کتاب الکترونیکی توسط پرتال بیوانفورماتیک ایرانیان انتشار یافته است و هر  گونه انتشار این نسخه الکترونیکی به صورت چاپی ممنوع میباشد
کاری از بابک باباعباسی
babakbabaabasi@gmail.com
نوشته شده توسط babak babaabasi ساعت 05:34 ب.ظ موضوع مطلب :‌ كتاب هایی در زمینه بیوانفورماتیك ,

ویرایش شده در یکشنبه 13 تیر 1389 و ساعت 10:30 ب.ظ

لینك ثابت | نظرات ()

جمعه 4 تیر 1389
ده تا از مهمترین دیتا بانکهای بیوانفورماتیکی

Ten Important Bioinformatics Databases

GenBank www.ncbi.nlm.nih.gov nucleotide sequences

Ensembl www.ensembl.org human/mouse genome (and others)

PubMed www.ncbi.nlm.nih.gov literature references

NR www.ncbi.nlm.nih.gov protein sequences

SWISS-PROT www.expasy.ch protein sequences

InterPro www.ebi.ac.uk protein domains

OMIM www.ncbi.nlm.nih.gov genetic diseases

Enzymes www.chem.qmul.ac.uk enzymes

PDB www.rcsb.org/pdb/ protein structures

KEGG www.genome.ad.jp metabolic pathways

در این بانکهای جستجو کنید به دو دلیل

به اطلاعات خود افزوده میکنید

دوم این که هر کاری که در این بانکهای انجام دهید باعث خراب کاری نمیشود!

اطلاعات بیشتر اگر میخواهید از کتابهای الکترونیکی این صفحه استفاده کنید

http://www.ibp.ir/FreeE-Book.htm

نوشته شده توسط babak babaabasi ساعت 04:54 ب.ظ موضوع مطلب :‌ درس یك بانكهای اطلاعاتی ,

ویرایش شده در جمعه 4 تیر 1389 و ساعت 05:04 ب.ظ

لینك ثابت | نظرات ()

پنجشنبه 3 تیر 1389
کتاب الکترونیکی بانکهای اطلاعاتی اولیه بیوانفورماتیک, GenBank ،Refseq ، SwissProt ،PIR ،UniProt ،PDB ، Entrez SRS
کتاب الکترونیکی در رابطه با بانکهای اطلاعاتی اولیه به زبان فارسی را در صفحه زیر ببینید
http://www.ibp.ir/el/____Primary_Databanks_ims/
فهرست مطالب موجود در این کتاب به شرح زیر هست
    * مقدمه
    * پایگاه داده‌ها چیست؟
    * انواع پایگاه داده ها
    * پایگاه‌ داده‌ها در علوم زیستی
    * پایگاه‌های اطلاعاتی اولیه داده‌های زیستی
    * پایگاه های اطلاعاتی اولیه توالی DNA
          o معرفی GenBank
          o پایگاه داده‌های Refseq
    * جستجوی متنی توالی‌های نوكلئوتیدی
    * پایگاه های اطلاعاتی اولیه توالی‌های پروتئینی
          o ۱- پایگاه اطلاعات پروتئینی SwissProt
          o ۲- پایگاه اطلاعات پروتئینی (PIR (Protein Information Resource
          o UniProt
    * پایگاه‌ داده‌های ساختار فضایی پروتئین‌ها
          o (PDB (Protein Data Bank
    * سامانه‌های بازیابی اطلاعات از پایگاه های داده‌ها
          o 1- Entrez
          o 2-(SRS (Sequence Retrieval System

این پایگاه‌ها حاوی اطلاعات توالی‌های DNA و پروتئین است كه به طور مستقیم از نتایج آزمایشگاهی حاصل شده‌اند (داده‌های تجربی یا ‌Experimental) و یا از تجزیه و تحلیل رایانه‌ای داده‌های موجود به دست آمده‌‌اند (داده‌های پیش‌بینی شده یا Predicted). در این نوع پایگاه‌ها مولکول‌های فوق با علائم یک حرفی شاخص نوکلئوتیدها و اسید های آمینه نوشته می شوند

در این کتاب الکترونیکی توضیحات جامع و کاملی را میابید
http://www.ibp.ir/el/____Primary_Databanks_ims
نوشته شده توسط babak babaabasi ساعت 12:03 ب.ظ موضوع مطلب :‌ مقالات بیوانفورماتیكی ,

ویرایش شده در - و ساعت -

لینك ثابت | نظرات ()

پنجشنبه 3 تیر 1389
همردیفی توالی و جستجوی BLAST, کتاب الکترونیک آموزش شیوه کار کردن با بلست
کتاب الکترونیک آموزش شیوه کار کردن با بلست را در آدرس زیر ببینید
http://www.ibp.ir/el/____BLAST_ims
مقایسه  دو  توالی
در دهه ۸0، یک محقق هیچ برنامه رایانه‌ای برای این که بتواند بین تعدادی توالی مشابه توالی را به توالی خود پیدا کند نداشت. بنابراین زبده ترین دانشمندان ان روزگار نیز مجبور بودند این کار را به صورت دستی انجام دهند. به طور مثال، اگر قرار بود از بین چهار توالی زیر مشابه ترین توالی را به توالی خود انتخاب می کرد. باید تک تک توالی ها را با توالی الگو مقایسه می کرد و میزان شباهت‌ها را در هر مقایسه به دست می آورد. امروزه به این همردیفی دوگانه (Pairwise Alignment) می گویند.   

ساده ترین راه برای مقایسه کردن دو توالی این است که هر بار دو توالی را در زیر هم قرار دهیم و یک به یک باز ها را با هم مقایسه کنیم تا شبیه ترین توالی را پیدا کنیم (شكل‌های A تا D زیر). ولی سوالی که پیش می‌آید این است که چگونه و با چه معیاری دو توالی مشابه تر را انتخاب می‌کنیم؟ در این جاست که بحث امتیاز دهی (Scoring) مطرح می شود. به عنوان مثال، ساده ترین نوع امتیاز دهی این گونه می تواند باشد که اگر دو بازی که زیر هم قرار می گیرند از یکسان باشند، امتیاز 1 و اگر همسان نباشند، امتیاز صفر داده  شود. با این روش می توان مشابه ترین توالی و درجه شباهت سایر توالی ها را با توالی الگو به دست آورد.

حال توالی‌های بالا را با توالی الگوی داده شده با همین روش همردیفی دو گانه می‌كنیم. به نظر می‌رسد مورد C كه امتیاز ۹ گرفته است، همسانی بیشتری با توالی ما دارد

متن کامل را در آدرس زیر ببینید
http://www.ibp.ir/el/____BLAST_ims
نوشته شده توسط babak babaabasi ساعت 12:02 ب.ظ موضوع مطلب :‌ نرم افزارBLAST ,

ویرایش شده در - و ساعت -

لینك ثابت | نظرات ()

پنجشنبه 27 خرداد 1389
متشکر میهن بلاگ
با سلام
این پست رو به افتخار میهن بلاگ مینویسم
امروز در صفحه اول میهن بلاگ دیدم که به عنوان وبلاگ منتخب معرفی شدم  و خواستم اینجا  تشکری کرده باشم و هم بگم که میهن بلاگ ما هم تو رو منتخب میدونیم
سال 85 بود که شروع کردم در میهن بلاگ به نوشتن ابتدا در مورد زیست سلولی مینوشتم و بعد از آشنایی با بیوانفورماتیک و نبودن هیچ منبع فارسی شروع به تحقیق در این مورد کردم و اکثر چیزهایی که یاد میگرفتم رو در وبلاگ قرار میدادم
در این مدت چند باری هم میهن بلاگ دچار افت و خیزهایی شد و یک بار هم کل مطالب وبلاگم از دست رفت ولی همیشه یک چیزی باعث میشد تا میهن بلاگ رو ترک نکنم  و با تمام اتفاقات کنارش موندم   و حالا پنج سال هست که با هم دوستیم.
و حالا میهن بلاگ  با مدیریت جدید و با سیاست جدیدی که در پیش گرفته در کنار نویسندگان مدام به ارائه خدمات جدید میپردازه  که باعث میشه نویسندگان وبلاگ خودشون رو تنها ندونن...
برای همه کارکنان میهن  بلاگ و وبلاگ نویسان عزیز که سعی دارند وب فارسی را با مطالب مفید خود پر بار کنند آرزوی موفقیت و شادکامی را دارم

http://blogs.mihanblog.com/post/55

WWW.MIHANBLOG.COM

نوشته شده توسط babak babaabasi ساعت 09:24 ب.ظ موضوع مطلب :‌ عمومی ,

ویرایش شده در پنجشنبه 27 خرداد 1389 و ساعت 09:42 ب.ظ

لینك ثابت | نظرات ()

دوشنبه 24 خرداد 1389
کتاب بیوانفورماتیک (داده پردازی زیستی)
نام کتاب:بیوانفورماتیک (داده پردازی زیستی)

نویسنده:نقوی- ملبوبی
مترجم:
موضوع:علوم پزشكی
انتشارات:دانشگاه تهران
خلاصه کتاب:چاپ ول 1388 329صفحه شامل علوم زیست افورماتیک -ژنتیک- علوم زیستی
قیمت به ریال :66000
مقدمه:
بیوانفورماتیك شاخه ای از علم زیست شناسی است كه به ذخیره، تجزیه و تحلیل و تفسیر اطلاعات آزمایشی حاصله می پردازد. امروزه به دلیل وجود اطلاعات فراوان در علم زیست شناسی نیاز فراوانی به كامپیوتر وجود دارد. ابزار های بیوانفورماتیك شامل كامپیوترها، پایگاههای اطلاعاتی ، روشها و الگوریتم آماری می باشند كه جهت تجزیه و تحلیل  داده ها مورد استفاده قرار می گیرند. اهداف بیوانفورماتیك، استخراج اطلاعات و شناسایی روابط بین این مجموعه داده ها است. داده ها در اغلب موارد شامل توالی اسیدهای نوكلئیك و پروتئین، ساختارهای پروتئینی، پروفیل های بیان ژن، وزن ملكولی تصاویر مسیرها متابولیكی یا بیوشیمیایی و ژن ها هستند.بیوانفورماتیك به عنوان یك حوزه علمی در اواسط دهه 1990 بدلیل افزایش داده های ژنومی، بیوشیمیایی و ساختاری بوجود آمد. البته ریشه این علم به دهه 1960 برمی گردد، هنگامیكه مارگارت دی هوف اولین پایگاه اطلاعاتی توالی های پروتئینی را بنا نهاد. کتاب حاضر اولین کتاب جامع به زبان فارسی در مورد بیوانفورماتیک است که شامل 11 فصل بوده و در 450 صفحه نگارش شده است. این کتاب مورد استفاده دانشجویان گروه های زیست شناسی ، پزشکی و کشاورزی  می باشد.
عنوان فصل ها:
مقدمه ای بر بیوانفورماتیک /
ساختار و اصول توالی یابی  DNA و پروتئین
ژنومیکس ساختاری
ژنومیکس عماکردی
اطلاعات و ابزارهای موجود  در بانک های اطلاعاتی
معرفی بانک های اطلاعاتی
همردیفی توالی های DNA و پروتئین
پیش بینی ژن
پیش بینی ساختار RNA
پیش بینی ساختار و تعیین عملکرد پروتئین
تجزیه های فیلوژنتیکی
فرهنگ واژه ها
ضمیمه
برای رفتن به فروشگاه فروشنده این کتاب اینجا را کلیک کنید
نوشته شده توسط babak babaabasi ساعت 05:23 ب.ظ موضوع مطلب :‌ كتاب هایی در زمینه بیوانفورماتیك ,

ویرایش شده در دوشنبه 24 خرداد 1389 و ساعت 05:26 ب.ظ

لینك ثابت | نظرات ()

سه شنبه 11 خرداد 1389
طرح بیو بانک انگلستان
یک بحثی در ژنتیک وجود دارد به عنوان وراثت چند ژنی و چند عاملی
برخی پروژهایی برای رمز گشایی از وراثت های چند عاملی در شروع راه هست
در ده سال گذشته شاهد به کار گرفتن شمار بسیاری از بیماران و افراد کنترل برای تهیه منابع ارزشمند  دی ان ای برای مطالعه بوده ایم که جمع آوری این نمونه ها در حال گسترش است.
برای نمونه ، هدف طرح بیوبانک انگلستان جمع آوری نمونه های دی ان ای همراه با اطلاعات مربوط به سلامتی و شیوه زندگی 500000 داوطلب در سنین 40تا 69 سال است.
در خلال 20 تا 30 سال آینده پژوهشگران صاحب صلاحیت قادر خواهند شد تا با استفاده از این منابع مراحل پیشرفت بیماریهایی مانند سرطان ، بیماری قلبی ، دیابت ها  و آلزایمر را مورد مطالعه قرار دهند.
از این رهگذر آنها  امیدوارند که راههای نو و بهتر پیشگیری و درمان این مشکلات  فراهم آید

برای اطلاعات بیشتر وبسایت این پروژه را جستجوکنید
http://www.ukbiobank.ac.uk

مباحث اخلاقی زیادر در این پروژه نیز نهفته میباشد  که در آینده در رابطه با آنها بحث خواهیم کرد
نوشته شده توسط babak babaabasi ساعت 10:56 ب.ظ موضوع مطلب :‌ مقالات بیوانفورماتیكی ,

ویرایش شده در - و ساعت -

لینك ثابت | نظرات ()

سه شنبه 11 خرداد 1389
پروژه بین المللی "هاپ مپ"(International "HapMap" Project
پروژه بین المللی هاپ مپ" (International HapMap Project)

این پروژه شباهتها و تفاوتهای ژنتیکی در انسان را با مطالعه ژنهای منقرض شده در تمام جمعیتهای ساکن زمین نشان می دهد.
برای دست یابی به اطلاعات  این پروژه از سایت زیر استفاده کنید
http://www.hapmap.org

تاکنون "هاپ مپ" تنها برای شناسایی ارتباط میان ژنها و بیماریها مورد استفاده قرار می گرفت، اما اکنون این دانشمندان نشان دادند که این اطلاعات می توانند برای ردیابی نقشه تغییرات ژنتیکی جمعیتهای انسانی دورانهای گذشته نیز مفید باشند.

پروژه "هاپ مپ" تفاوتهای فردی را در یک  DNA که از "ژنهای چند ریختی" در یک "نوکلوتئد"(SNPs)  به دست آمده نشان می دهد و تاکنون در حدود 4 میلیون از مجموع 10 میلیون چندریختی را که در ژنوم انسان وجود دارد طبقه بندی کرده است.

این محققان با کمک این اطلاعات موفق شدند نشان دهند که انتخاب مثبت به طور فعال روی هزار و 800 ژن عمل کرده است که این تعداد ژن برابر با 7 درصد از میراث ژنتیکی انسان است.

نواحی اس ان پی های پیوسته به عنوان هاپلو تایپ خوانده میشود
این طرح هاپلوتایپ ها را در جمعیت های مختلف شناسایی میکند
لازم به ذکر است که دو انسان از لحاظ ژنتیکی 99.9 درصد به هم شباهت دارند و آن یک دهم درصد به تفاوتهای جزئی ژنتیکی میباشد
برای فراگیری بیشتر برای  پیرامون مستعد شدگی ژنتیکی که در بیماریهای رایج مانند بیماری  قلبی دریچه ای ،دیابت ، سرطان و ناهنجاریهای خود ایمنی و روانی مورد تاکید قرار میگیرد ،طرح هپ مپ منبع سود مندی را  فراهم خواهد کرد.

البته به نکات اخلاقی و ظریف این طرح ها باید توجه شود به همین دلیل اطلاعات این طرح ها به احتمال قوی در اختیار اشخاص خاصی قرار خواهد گرفت البته باز هم نگران کننده خواهد بود ،در بحث های بعدی اگر مجالی  باشد از خطرات اخلاقی این پروژها بحث خواهم کرد
نوشته شده توسط babak babaabasi ساعت 10:54 ب.ظ موضوع مطلب :‌ مقالات بیوانفورماتیكی ,

ویرایش شده در - و ساعت -

لینك ثابت | نظرات ()

سه شنبه 11 خرداد 1389
پروژه ژنوم انسان و دستاوردهای آن
دانشمندان با گذشت 7 سال از زمان ارائه اولین توالی کامل ژنوم انسان، به استقبال دستاوردها و پیشرفتهای جدید تر شتافته و آرزوهای فراوانی را برای دهه در پیش رو در سر می پرورانند.
قبل از هر چیز میتوانید برای به دست آوردن داده های اطلاعات این پروژه به سایت زیر مراجعه کنید
http://www.ncbi.nlm.nih.gov
نرم افزار mapviewer در این سایت اجازه میدهد اطلاعات ژنومی بسیاری از موجودات را به طور گرافیکی و متنی بازیابی نمود. برای ورود به mapviewer از لینک زیر استفاده کنید
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/mapview

در سال 2003 دانشمندان برای معرفی دستاورد "پروژه ژنوم انسان"، پروژه ای که به رمزگشایی کامل دی ان ای انسان منجر شده بود در کاخ سفید به بیل کلینتون، رئیس جمهور آن زمان آمریکا ملحق شدند.  پروژه ای که 2 ملیارد دلار  هزینه گرفت و 12 سال به طول انجامید.با گذشت 7 سال از آن زمان و سالگرد 7 سالگی این دستاورد بزرگ دانشمندان دستاوردهای علمی این پروژه را مورد بررسی قرار داده و امیدوارند با استفاده از اطلاعات به دست آمده از این پروژه بتوانند پیشرفتهای آینده را در این دامنه از علم پیش بینی کنند.

دستاوردهای پروژه ژنوم انسان

1- بهبود دادن اطلاعات: با همکاری وزارت انرژی آمریکا و موسسه ملی بهداشت، پروژه ژنوم انسان در ترویج رویه کنونی ارائه آنلاین و رایگان اطلاعات پیش گام به شمار می رود. این رویه شیوه ای تحقیقاتی را رواج داد که به محققان امکان می داد با سرعتی بالاتر از گذشته به اکتشاف بپردازند. به گفته "فرانسیس کالینز" رئیس موسسه ملی بهداشت و یکی از فعالان پیشین در ارائه توالی ژنوم انسان تنها مواردی که دانشمندان فعال در زمینه ژنوم انسان به آن نیاز دارند، اینترنت، مواد شیمیایی ارزان قیمت، ماشین چرخه ای حرارتی و دسترسی به یک ترتیب سنج دی ان ای است.

2- افزودن دی ان ای به "بسته منشاء انسانی": "مارک مک کارتی" از دانشگاه آکسفورد که بر روی دلایل ژنتیکی دیابت و چاقی مطالعه می کند، معتقد است پروژه ژنوم انسان ثابت کرد ژن ابزاری ارزشمند برای مطالعه بر روی منشا انسان و تاریخچه مهاجرتهای انسانهای پیشین به شمار می رود. با کمک اطلاعات این پروژه انسان توانسته است سن واقعی گونه خود و شباهتهای موجود میان بسیاری از انسانها را کشف کند، به ویژه جمعیتهای انسانی که منشا آنها به&nbsp70 هزار سال پیش از آفریقا باز می گردد. در عین حال اطلاعات ژنتیکی این پروژه نظریه های وابسته به باستان شناسی و زبان شناسی را نیز مورد حمایت و پوشش خود قرار داده است.

3- دستیابی به نشانه های منشاء ما قبل تاریخ بیماری ها: پروژه ژنوم به گونه ای به پایه و اساس پروژه های دیگری از قبیل HapMap که با هدف کشف SNPها یا چند شکلی های تک نوکلئوتیدی شکل گرفته بود تبدیل شد. SNPها تفاوتهای نشانه گذاری ژنها در میان اعضای یک گونه مشابه هستند و حروف مورد استفاده برای نشانه گذاری حروف A,T,C و G هستند. پروژه HapMap کاتالوگی از SNPهای رایج موجود میان انسانها است. این تفاوتها می توانند بر روی میزان آسیب پذیری انسانها در برابر بیماری هایی ویژه از جمله سرطان، بیماری های قلبی و دیابت تاثیرگذار باشد.

4-  کشف کمبود ژن در دی ان ای انسان: قبل از آغاز پروژه ژنوم انسان، برخی از دانشمندان تخمین زده بودند سه بیلیون از حروف دی ان ای در تشکیل بیش از صدها هزار ژن نقش دارند اما اطلاعات به دست آمده از این پروژه نشان داد تعداد ژنهای موجود در ژنوم انسان از حد انتظار بسیار کمتر است. این پروژه نشان داد ژنوم انسان دارای 20 هزار تا 25 هزار ژن است و این به آن معنی است که هر یک از ژنها از پیچیدگی های بسیار زیادی برخوردارند. به گزارش مهر، به دلیل محدودیت حروف دی ان ای استفاده شده در هر ژن مشخص شد در حدود 98.5 درصد از دی ان ای انسان با ژنها در ارتباط نیست و از این رو برخی این بخش را  "دی ان ای زباله" می نامند.

5- تحقیقات ژنتیکی بیشتر: از دیگر دستاوردهای پروژه ژنوم انسان، پرورش دادن نسلهای جدیدتر، سریعتر و ارزان قیمت تری در توالی ژنتیکی بوده است. توالی ژنتیکی که 10 سال پیش از ژنوم انسان به دست آمد اکنون به عنوان مرجعی برای مقایسه اطلاعات به دست آمده از شیوه های جدید رمزگشایی ژنوم انسان مورد استفاده قرار می گیرد.

پیش بینی 10 سال آینده مطالعات ژنتیکی

1- کشف منشاء دقیق انسان: دانشمندان در آینده ای نه چندان دور قادر خواهند بود با مقایسه ژنوم انسانهای مدرن با دیگر گونه ها منشا دقیق انسانها را در تاریخ کشف کنند.

2- ژن درمانی بیماری های را ریشه کن خواهد کرد: این شیوه درمانی، درمان با کمک جایگزینی ژنهای مختل، طی 10 سال آینده در نهایت به واقعیت تبدیل خواهد شد و بسیاری از بیماری های لاعلاج امروزی را درمان خواهد کرد.

3- تغییر مفهوم ژن: مفاهیم سنتی می گویند ژن منطقه ای از دی ان ای است که پروتئینها را رمزگذاری می کند. اما در سالهای اخیر دانشمندان موفق به کشف بخش زباله دی ان ای شده اند، بخشی که پروتئین نمی سازد  اما در عین حال از اهمیت برخوردار است. به گزارش مهر، این کشف می تواند بیانگر این موضوع باشد که امکان تغییر مفهوم ژن با ادامه یافتن مطالعات ژنتیکی وجود خواهد داشت.

4- شخصی سازی ژنوم به واقعیت تبدیل می شود: متخصصان معتقدند با کمک گرفتن از جدیدترین فناوریها تا پنج سال آینده هر انسانی قادر خواهد بود به ازای کمتر از هزار دلار به توالی ژنتیکی خود دسترسی داشته باشد که این فرایند با گذشت زمان کم هزینه تر نیز خواهد شد.

5- تعیین شخصیت افراد به علم تبدیل می شود: با درک بهتر اطلاعاتی که در ژنوم انسان نهفته است، دانشمندان قادر خواهند بود بر روی تاثیرات فیزیکی و ذهنی ژنها بر روی انسانها اطلاعات بیشتری به دست آورند. به این شکل در آینده ای دور امکان تشخیص شکل ظاهری و خصوصیات رفتاری یک انسان تنها با کمک گرفتن از اطلاعات ژنتیکی وی امکان پذیر خواهد بود.
نوشته شده توسط babak babaabasi ساعت 10:53 ب.ظ موضوع مطلب :‌ مقالات بیوانفورماتیكی ,

ویرایش شده در - و ساعت -

لینك ثابت | نظرات ()