سلام

سومین همایش بیوانفورماتیک توی پژوهشکده بیوتکنولوژی و مهندسی ژنتیک برگزار شد.

من به صورت پوستر شرکت داشتم

البته پوستر برتر هم نشدم

سخنرانی ها هم اکثرا حول محور الگوریتم نویسی ها و ماتریس ها بود و مباحث ریاضی بود

در بخش پوسترها بیشتر پوسترهای  مقالاتی بود که  در فاز بیوتکنولوژی  از نرم افزارهای بیوانفورماتیکی استفاده کرده بودند

در کل خوب بود

چند تا شرکت هم بودند که با یکیشون یک مقدار صحبت کردم قرار شد اگر تمایل داشتم در آینده  نرم افزارهای آموزشی که میسازم رو در اختیارشون قرار بدم تا اونها پخش کنن

و یک مقدار در رابطه با برنامه های آموزش الکترونیک که در  ذهن دارشتم صحبت کردیم

حالا باید ببینیم آینده چه چیزی در مسیرم قرار میده

فعلا در نظر دارم یک سری ملتی مدیاهای آموزشی در رابطه چند نرم افزار مهم بیوانفورماتیکی ایجاد کنم

دو تا از دوستان قدیمی که یکی از هم کلاسی ها و یکی دیگه از دوستان بود رو تو پژوهشکده دیدم

تو پژوهشکده رشته سلولی و مولکولی قبول شده بودند در مقطع کارشناسی ارشد و در اونجا تحصیل میکردند

فضای علمی و پژوهشی و آزمایشی عالی در اختیارشون هست

دوستم میگفت تمام دانشجویان دانشگاههای مختلف اگر تمایل دارند میتونند یک استاد راهنما در دانشگاه خودشون و یک استاد راهنما در اینجا داشته باشند و پایان نامشون رو اینجا انجام بدن البته خودتون هم پرس و جو کنید

من یه نگاهی به آزمایشگاههای مولکولی انداختم واقعا امکانات خوبی در اختیار اساتید و دانشجویان است و کتابخانه خوبی رو هم در اختیار دانشجویان قرار میدن

یه جای خوب برای رشد علمی هستش

راستی دکتر ملبوبی رو هم دیدم

میگفتن دارن یه سایتی در رابطه با فسفات یا فسفر درست میکنند تا اطلاعاتش رو دسته بندی کنند

کار جالبی خواهد شد حتما و یه سایت ایرانی در رابطه با یک بانک بیوانفورماتیکی خواهد بود

امیدوارم همه موفق باشن این هم یه گزارش از همایش بیوانفورماتیک و پژوهشکده بیوتکنولوژی و مهندسی ژنتیک

بعد از طراحی نرم افزار GMP  با درخواست دوستان مقاله ای برای نرم افزار نوشتم و برای سومین همایش بیوانفورماتیک ایرانیان فرستادم

نتیجه اش این شد

Congratulations, your submission "Design of GMP software for analysis of
genome and amino acid sequences,"  has been accepted as a poster
presentation at Iranian Conference on Bioinformatics which is being held
2010-01-05 at National Institute of Genetic Engineering and Biotechnology,
Tehran, Iran

در این که چرا به صورت پوستر پذیرفته شد نه برای سخنرانی کاملا مشخصه چون داورهای عزیز اول به مدرک تحصیلی و سپس به این که آیا من این شخص رو میشناسم و یا نه بیشتر توجه میکنند تا خود مقاله

البته من کمتر در رابطه با الگوریتم ها نوشتم و اکثرا اساتید عاشق درشت نویسی هستند ولی من همیشه ساده مینویسم

و کار من نسبت به کسانی که دانشجوی  دکتری و یا ارشد هستند و پایان نامهاشون رو ارائه میدن پایین تر هستش البته من قبول داریم هنوز خیلی مونده بزرگ بشم

اما.....

سه شنبه و چهار شنبه این هفته در پژوهشکده ملی بیوتکنولوژی و مهندسی ژنتیک برگزار خواهد شد

http://icb.ut.ac.ir/

Course Coordinating Committee:

1. Dr. Sushma M. Bendre- Outliers and Regression Diagnostics (Department of Mathematics and Statistics, MCIS).
2. Dr. K. Lalitha Guruprasad - Structural Biology (School of Chemistry)
3. Dr. Rajeev Wankar - Parallel & Grid Computing. (Department of Computer and Information Sciences, MCIS).

The scientists of CDFD participating in the course:

1. Dr. Shekhar Mande - Structural Biology
2. Dr. Akash Ranjan - Computational and Functional Genomics
3. Dr. H. A. Nagarajaram - Computational Biology

The Course structure includes Computational Techniques, Proteomics, Basic Statistics, Basic Mathematics and Introduction to Molecular Modeling in the First semester; Genomics, Databases, Bioinformatics, Introduction to Molecular Mechanics in Second semester, Drug Design and Advanced Bioinformatics in the third semester. Students are encouraged to choose one elective course in second and third semesters from other Schools. The students will carry out a project work during 3rd & 4th semesters under the guidance of a faculty member either at University of Hyderabad or CDFD.

The programme also offers remedial courses in the first semester to bring all the new students, who may not have sufficient experience with computers or biology, to a common level.

با سلام

بعضی از بخشهای نرم افزار BMB GMP از لحاظ فونتی دارای مشکل بود که اصلاح شد از لینک زیر  میتونید نسخه جدید را دانلود کنید

با دادن نظرات ارزشمند خود یاری رسان من باشید

http://up.iranblog.com/2/1256589703.zip

موفق باشید

لینک نرم افزار

 BMB GMP

این اولین تجربه برنامه نویسی من در این زمینه بود من در عنوان دو تا پست قبلتر  نوشتم اولین که خیلی ها خیال کردن اولین نرم افزار  در صورتی که چون وبلاگ شخصیم هست منظورم اولین تجربه بود

شاید نمونه خارجی این نرم افزار تو بازار باشه ولی من نه کد نویسی ها و نه اجرای برنامه رو الگو برداری نکردم

بعد از اینکه ثبتش کردم و یا در یک همایش معتبر ارائه دادمش سورسش رو هم قرار میدم تا دوستان دیگر کاملش کنن

کار من کار فوق العاده ای نیست ولی سعی کردم در این شرایط و این امکانات از زمان بهترین استفاده رو ببرم و یه تجربه جدید خلق کنم

و سعی کردم از توابع ویژوال بیسیک استفاده هوشمندانه ای بکنم

با نرم افزار کار کنید و نظراتتون رو هم به من بدید

http://up.iranblog.com/2/1256189554.zip

امیدوارم کار با نرم افزار لذت بخش باشه

سلام

دیروز با کلی ذوق نوشتم نرم افزار رو ساختم و لینکش رو توی سایت گذاشتم تا دیگران استفاده کنن

با سه یا چهار تا از دوستان همون موقه صحبت میکردم گفتن که اول نرم افزارت رو ثبت کن و بعد بزار توی سایت و من امروز در این رابطه سرچ کردم که مراحل خیلی زیادی و سختی داره که فکر کنم حد اقل یک ماه طول بکشه

خدا به من رحم کنه

قول میدم من مثل اینها نباشم زود ثبتش کنم و بعد سریع میزارم توی سایت برای دانلود رایگان

بگم خدا چی کار کنه این ایده دزد ها رو که آدم رو مجبور به ثبت میکنن در غیر این صورت من اهل این جور چیزها نبودم.........

مراحلش اینها هستند

متقاضی ثبت نرم‌افزار به منظور دریافت گواهی تأئیدیه فنی برای نرم‌افزار خود باید مراحل زیر را به ترتیب طی کند:

مرحله اول

مرحله سوم(وزارت ارشاد)

·          متقاضیان برای دریافت شماره شناسایی نرم‌افزار می‌باید با در دست داشتن گواهی تأییدیه فنی نرم‌افزار(صادر شده توسط دبیرخانه شورا) به وزارت ارشاد و فرهنگ اسلامی مراجعه نمایند. برای آگاهی از مدارك مورد نیازhttp://www.softreg.ir را كلیك نمائید.

که خود وزارت ارشاد یه عالمه فرم داره

خدا خیر کنه و امیدوارم از پس این مراحل بر بیام که از نرم افزار نوشتن هم سخت تره

سلام

.........اون بالا تو موضوع نوشته بودم اولین که منظورم اولین کار خودم بود و دوستان برداشت اشتباه کردن منظورم اولین اولین نرم افزار تحلیل ژنوم نیست بلکه منظورم اولین کار خودم در رابطه با طراحی نرم افزاری به منظور تحلیل داداهای ژنوم بود...............

حدود  3 سال مطالعه در زمینه بیوانفورماتیك

و حدود 5 ماه  یاد گیری ویژوال بیسیك و قبل از اون مطالعه ذر رابطه با زبانهای برنامه نویسی مختلف و انجام پروژه های مختلف

و سه ماه كد نویسی بدون اجازه در سربازی با كامپیوتر آزمایشگاه در وقت ناهار و....

بالاخره نرم افزار  BMB GMP  رو ساختم چیری كه چند سالی تو ذهنم بود و حالا باید گسترشش بدم

این نرم افزار چهار فعالیت اصلی رو انجام  میده و چند ین فعالیت جانبی

نمونه این نرم افزار رو خارجی ها ساختن سالها پیش

من به هیچ وجه الگو برداری نکردم چه در ساختار و چه در کد نویسی و هیچ کس تا به حال با ویژوال بیسیک از این برنامه ها نساخته بود

از لینك زیر میتونید دانلودش كنید و ازش استفاده كنید

نظراتتون رو هم به من خبر بدید

http://up.iranblog.com/2/1256189554.zip

من میرم استراحت كنم امروز كارم تمام شد و ذوق زده بودم تا اینجا بنویسم

فکرکنم این اولین نرم افزار بیوانفورماتیكی هست كه تو ایران ساخته میشه

البته من همیشه تو اینترنت میگردم تا نرم افزارهای جدید رو پیدا کنم و تا به حال ایرانی رو ندیدم که نرم افزاری طراحی و یا در اینترنت معرفی کرده باشه

البته همه میدونیم طراحی کردن نرم افزار بدون ارائه اون به دیگران فقط یک خود فریفتن  هستش

و بعضی دوستان  طراحی یک الگوریتم و یا چند تا از کدنویسیهاشون در برنامه های مختلف رو به نام نرم افزار اعلام میکنن البته باید بدونیم نرم افزار یعنی اینکه به حالت اگزه در اختیار دیگران قرار بدهیم حالا به صورت دینامیک در اینترنت و یا بر روی سی دی و یا با قابلیت دانلود در اینترنت

و امیدوارم مفید فایده باشه

موفق باشید