تبلیغات
بیوانفورماتیك,bioinformatics,بیوانفورماتیک - جستجو و بازیابی اطلاعات – پروتئینها در سایت Expasy
بیوانفورماتیك,bioinformatics,بیوانفورماتیک
تنها پایگاه آموزش بیوانفورماتیک به زبان فارسی,www.ibp.ir,این ویلاگ زیر مجموعه پرتال بیوانفورماتیک ایرانیان میباشد به آدرس
شنبه 20 مرداد 1386

جستجو و بازیابی اطلاعات – پروتئینها در سایت Expasy

شنبه 20 مرداد 1386

جستجو و بازیابی اطلاعات – پروتئینها در سایت Expasy

اگر به ده پست قبل از این مطلب(درس 7 پروتئین دیتا بانك pdb) كه در رابطه با pdb

(جستجو و بازیابی اطلاعات - پروتئینها در سایت pdb) بود توجه كنید در ان قسمت توضیحات كاملی در رابطه با جستجو و انواع فرمتهای ذخیره سازی ارائه كردم امروز فقط به صورت خلاصه در رابطه با جستجو در سایت expasy توضیحاتی را خدمت شما ارائه میكنم

Expasy((Expert Protein Analysis System)

از طریق این آدرس http://www.expasy.org میتوانید وارد سایت شوید همان طوری كه تصویر سایت را در زیر میبینید همانند سایت ncbi  و pdb در بالای این سایت نیز محلی برای جستجو قرار دارد شما میتوانید پروتئین مورد نظر خود را در كادر سمت راست وارد كنید مثلا در كادر كلمه dUTPase coli را تایپ كنید و با كلیك بر روی GO سایت شروع به جستجو میكند در صفحه ای دیگر نتایج جستجو مشاهده میشود

توجه كنید در این قسمت دو كار را میتوانید انجام دهید....

برای مطالعه بقیه مطلب در زیر بر روی ادامه مطلب كلیك كنید

 بر روی یكی از نتایج جستجو كلیك كنید و وارد یك صفحه زرد رنگ میشوید كه اطلاعات كامل در مورد پروتئین وجود دارد در این صفحه در پایین صفحه سمت راست بر روی FASTA format كلیك كنید كه توالی پروتئین را به نمایش در میاورد

كار دومی را كه میتوانید انجام دهید این است كه بر روی هیچ یك از نتایج  جستجو كلیك نكنید و در پایین صفحه كادری وجود دارد در آن كادركه با نام filename  مشخص شده است یك نام به دلخواه تایپ كنید مثلا bmb  سپس FASTA را انتخاب و دکمه create file را كلیك كنید.

بعد از این مرحله صفحه ای باز میشود كه ظاهرا خالی است و اكثرا اشتباه میكنند اگر توجه كنید در بالای صفحه چند خط مطلب و جود دارد كه در انتهای متن كلمه now به رنگ آبی وجود دارد بر این كلمه كلیك كنید در این صفحه سایت تمامی مواردی را كه در جستجو پیدا كرده بود به ترتیب به فرمت fasta نمایش میدهد فرمت fasta را به طور كامل در پستی كه در رابطه با سایت pdb میباشد توضیح دادم

نكته:

فایل های خود را در فرمت txt ذخیره كنید در غیر این صورت ممكن است داده های بدست آمده دجار اشكال گردند.می توانید با استفاده از منوی Edit گزینه Select All و سپس Edit گزینه Copy و با انتخاب برنامه مناسب فایل خود را Paste نموده با فونت مناسب 8 تا 10 و در فرمت txt ذخیره نمایید.